Для создания динамической структуры, в архитектуре «Музея слияния» используются темы контрастов и отклонений. Огромная структура музея, объединяющая технологии, биологию и этику, одновременно выступает как в качестве музея, так и площадки для культурного досуга, образуя активное и оживленное место.

Дизайн музея характеризуется тремя основными компонентами: «цоколь», «кристалл» и «облако». Расположенный под главным входом в «Музей слияния», «цоколь» включает в себя аудитории, конференц-залы и технические площадки. Обращенный к городу «кристалл» приветствует посетителей, выступает в качестве открытой публичной области, в то время как большие оконные стекла в стальных рамах наполняют внутреннее пространство дневным светом. Контрастируя с точными контурами второго уровня, «облако» напоминает возвышающийся над музеем космический корабль.

Очертания выставочных залов обыгрывают темы несоответствия и сложности, с закрытыми черными ящиками, чередующимися с открытыми площадками галерей. С внешней стороны здания музея пандусы и пешеходные дорожки связывают структуру музея с прилегающим парком, образуя интегрированную городскую площадь.